Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp54bE9PXC0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp54bE9PXC0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms