Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trappc8E9PWG2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trappc8E9PWG2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms