Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc62E9PVD1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms