Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc17E9PVB5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc17E9PVB5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms