Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms