Protein–RNA interactions for Protein: C0HKG6

Rnaset2b, Ribonuclease T2-B, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaset2bC0HKG6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnaset2bC0HKG6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnaset2bC0HKG6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnaset2bC0HKG6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnaset2bC0HKG6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnaset2bC0HKG6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnaset2bC0HKG6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnaset2bC0HKG6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnaset2bC0HKG6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnaset2bC0HKG6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnaset2bC0HKG6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnaset2bC0HKG6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnaset2bC0HKG6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnaset2bC0HKG6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnaset2bC0HKG6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnaset2bC0HKG6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnaset2bC0HKG6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnaset2bC0HKG6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnaset2bC0HKG6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnaset2bC0HKG6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnaset2bC0HKG6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnaset2bC0HKG6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnaset2bC0HKG6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnaset2bC0HKG6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnaset2bC0HKG6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms