Protein–RNA interactions for Protein: B9EJI9

Tmem229a, Transmembrane protein 229A, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem229aB9EJI9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem229aB9EJI9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms