Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clip3B9EHT4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clip3B9EHT4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms