Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6133B2RY53 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm6133B2RY53 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm6133B2RY53 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm6133B2RY53 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm6133B2RY53 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm6133B2RY53 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm6133B2RY53 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm6133B2RY53 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm6133B2RY53 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm6133B2RY53 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm6133B2RY53 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm6133B2RY53 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm6133B2RY53 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm6133B2RY53 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm6133B2RY53 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm6133B2RY53 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm6133B2RY53 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm6133B2RY53 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm6133B2RY53 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm6133B2RY53 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm6133B2RY53 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms