Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pnldc1B2RXZ1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms