Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms