Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zscan5bB2RTN3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms