Protein–RNA interactions for Protein: B2RRL2

Jrkl, Jerky protein homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrklB2RRL2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
JrklB2RRL2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
JrklB2RRL2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
JrklB2RRL2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
JrklB2RRL2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
JrklB2RRL2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
JrklB2RRL2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
JrklB2RRL2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
JrklB2RRL2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
JrklB2RRL2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
JrklB2RRL2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
JrklB2RRL2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
JrklB2RRL2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
JrklB2RRL2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
JrklB2RRL2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms