Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf518bB2RRE4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf518bB2RRE4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms