Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbed5B2RPU8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zbed5B2RPU8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms