Protein–RNA interactions for Protein: B1AZ99

Otud3, OTU domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud3B1AZ99 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud3B1AZ99 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms