Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CK137956B1AYM9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms