Protein–RNA interactions for Protein: B1AV28

Gm14862, Predicted gene 14862, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm14862B1AV28 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm14862B1AV28 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm14862B1AV28 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms