Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Trabd2bB1ATG9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Trabd2bB1ATG9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trabd2bB1ATG9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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