Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prr29B1ARI9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prr29B1ARI9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prr29B1ARI9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prr29B1ARI9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prr29B1ARI9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prr29B1ARI9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prr29B1ARI9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms