Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc9bA3KGF9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms