Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CatsperbA2RTF1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms