Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AgrnA2ASQ1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AgrnA2ASQ1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms