Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI9

Pramef25, PRAME family member 25, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef25A2ASI9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms