Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb1A2AQ07 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms