Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms