Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm2A2A7B5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm2A2A7B5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms