Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calcoco2A2A6M5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms