Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nlrp1bA1Z198 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nlrp1bA1Z198 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms