Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Trav12-2A0N8N6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Trav12-2A0N8N6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Trav12-2A0N8N6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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