Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc173A0JLY1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms