Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H4

Trbv19, T cell receptor beta, variable 19 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv19A0A0B4J1H4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Trbv19A0A0B4J1H4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Trbv19A0A0B4J1H4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Trbv19A0A0B4J1H4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Trbv19A0A0B4J1H4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Trbv19A0A0B4J1H4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trbv19A0A0B4J1H4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trbv19A0A0B4J1H4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Trbv19A0A0B4J1H4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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