Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms