Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms