Protein–RNA interactions for Protein: V9GXJ1

Gm28036, Predicted gene, 28036, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28036V9GXJ1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm28036V9GXJ1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms