Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vstm4T1NXB5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms