Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc166S4R181 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms