Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gria3Q9Z2W9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria3Q9Z2W9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms