Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac5Q9Z2V6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms