Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Knop1Q9Z2Q2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms