Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vamp5Q9Z2P8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms