Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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Ubl3Q9Z2M6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ubl3Q9Z2M6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ubl3Q9Z2M6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ubl3Q9Z2M6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ubl3Q9Z2M6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ubl3Q9Z2M6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ubl3Q9Z2M6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ubl3Q9Z2M6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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