Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X0

Ccl27, C-C motif chemokine 27, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl27Q9Z1X0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl27Q9Z1X0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl27Q9Z1X0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms