Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ap3b1Q9Z1T1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms