Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lgr5Q9Z1P4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lgr5Q9Z1P4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lgr5Q9Z1P4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lgr5Q9Z1P4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lgr5Q9Z1P4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lgr5Q9Z1P4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lgr5Q9Z1P4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lgr5Q9Z1P4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lgr5Q9Z1P4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lgr5Q9Z1P4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lgr5Q9Z1P4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lgr5Q9Z1P4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lgr5Q9Z1P4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lgr5Q9Z1P4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lgr5Q9Z1P4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lgr5Q9Z1P4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lgr5Q9Z1P4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lgr5Q9Z1P4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lgr5Q9Z1P4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lgr5Q9Z1P4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lgr5Q9Z1P4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lgr5Q9Z1P4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lgr5Q9Z1P4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lgr5Q9Z1P4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lgr5Q9Z1P4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lgr5Q9Z1P4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lgr5Q9Z1P4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lgr5Q9Z1P4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lgr5Q9Z1P4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lgr5Q9Z1P4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lgr5Q9Z1P4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lgr5Q9Z1P4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lgr5Q9Z1P4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lgr5Q9Z1P4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lgr5Q9Z1P4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms