Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek4Q9Z1J2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek4Q9Z1J2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek4Q9Z1J2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek4Q9Z1J2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek4Q9Z1J2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek4Q9Z1J2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek4Q9Z1J2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek4Q9Z1J2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek4Q9Z1J2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek4Q9Z1J2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek4Q9Z1J2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek4Q9Z1J2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek4Q9Z1J2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek4Q9Z1J2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek4Q9Z1J2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek4Q9Z1J2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek4Q9Z1J2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek4Q9Z1J2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek4Q9Z1J2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek4Q9Z1J2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek4Q9Z1J2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nek4Q9Z1J2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nek4Q9Z1J2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nek4Q9Z1J2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nek4Q9Z1J2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nek4Q9Z1J2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nek4Q9Z1J2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nek4Q9Z1J2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nek4Q9Z1J2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nek4Q9Z1J2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nek4Q9Z1J2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nek4Q9Z1J2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nek4Q9Z1J2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek4Q9Z1J2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms