Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpne6Q9Z140 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms