Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Nup160Q9Z0W3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nup160Q9Z0W3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nup160Q9Z0W3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nup160Q9Z0W3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nup160Q9Z0W3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nup160Q9Z0W3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nup160Q9Z0W3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Nup160Q9Z0W3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nup160Q9Z0W3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nup160Q9Z0W3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nup160Q9Z0W3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nup160Q9Z0W3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nup160Q9Z0W3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nup160Q9Z0W3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nup160Q9Z0W3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nup160Q9Z0W3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nup160Q9Z0W3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Nup160Q9Z0W3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nup160Q9Z0W3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nup160Q9Z0W3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nup160Q9Z0W3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nup160Q9Z0W3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nup160Q9Z0W3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nup160Q9Z0W3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms