Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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Cldn13Q9Z0S4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Cldn13Q9Z0S4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Cldn13Q9Z0S4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Cldn13Q9Z0S4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Cldn13Q9Z0S4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Cldn13Q9Z0S4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cldn13Q9Z0S4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cldn13Q9Z0S4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn13Q9Z0S4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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