Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M3

Cdh20, Cadherin-20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh20Q9Z0M3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdh20Q9Z0M3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Cdh20Q9Z0M3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh20Q9Z0M3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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